水浴式pcr仪仪器本身有3个不同温度的水浴，用机械装置将带有反应管的架子移位和升降温度，使温度循环。优点：水为传热介质，温度易恒定，实时荧光定量pcr仪，热容量大；反应管形状无特殊要求，温度转换较快扩增效果稳定；具有较高的运行效率，扩增产物特---好。缺点：高温浴不稳定，水面需用液体石蜡覆盖；改变水浴温度所需时间较长，定量pcr仪，不易实施复杂程序（如套式pcr）的操作，仪器体积较大；室温影响温度下限。
我们上面提到了反应的原理，由此我们可以简单的推断：温度作为变性-复性-延伸的基本设置，这个是我们需要校准的一个项目。
那么在反应的过程中，温度示值与设定值是否准确，我们需要知道。这是个温度示值误差；因为我们需要升温，降温，升温，这是不是涉及到一个速率的问题，升降温的快慢，会直接影响到整个反应过程，所以，升降温速率也是我们需要考量的一个方向。仪器通过加热模块去控制温度，在快速升降温的过程中，仪器不可避免的会先升高/降低温度之后，再达到所设定的问题，这就是温度的过冲，这也是可能也是一个考量的指标。达到一定的温度之后，仪器要平衡一段时间（所设定的时间），而温度平衡的时间和设置的时间，是否一致，也是要考虑的一个方向。不同的dna模板，需要的温度和解链的时间不一样，pcr仪，如果解链的时间没达到要求，dna没有完全变性，在降温复性的过程中，会恢复到天然的状态。
pcr仪是什么以及分类：
通过pcr（聚合酶链式反应）技术，对特定dna进行扩增的仪器。
普通pcr仪：只进行pcr扩增的pcr仪，进口pcr仪，实际上是一个温控设备。
实时荧光pcr仪：在普通pcr仪的基础上增加荧光信号采集系统和计算机分析处理系统。
普通pcr仪只能实现dna的扩增，分析检测需要在扩增之后。而扩增后到检测分析的这个过程，因为要将样品中仪器中取出来，所以容易受到污染，同时也容易污染环境。
实时荧光pcr仪：在作为温控设备的同时加入荧光分析系统。
在扩增的同时，通过前期准备工作的时候，pcr扩增体系中加入荧光集团，而后通过荧光信号采集系统实时采集，存储数据，将检测分析步骤集中到仪器上，减少人员后续的检测操作，降低了污染和被污染的风险。
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